由于尖锐湿疣初期时不痛不痒，皮疹也不明显，多数患者一般无症状。损害大小及形状不等。可仅为数个，亦可为多数针头样大的损害：在阴肛部可长成大的肿瘤样物，有压迫感；有恶臭味；有时小的湿疣可出现阴部痛痒不适，病人可出现尿血和排尿困难；直肠内尖锐湿疣可发生疼痛、便血，而直肠内大的湿疣则可引起里急后重感。
男性患者好发于包皮系带、冠状沟、包皮、尿道、阴茎、肛门周围和阴囊。病症初期为淡红或污红色粟状大小赘生物，性质柔软，顶端稍尖，逐渐长大或增多。可发展成乳头状或囊状，基底稍宽或有带，表面有颗粒。在肛门部常增大，状如菜花，表面湿润或有出血，在颗粒间常积存有脓液，散发恶臭气味，搔抓后可继发感染。
位于湿度较低干燥部位的生殖器疣，损害常小而呈扁平疣状。位于湿热湿润部位的疣常表现为丝状或乳头瘤状，易融合成大的团块。有严重肝病的患者湿疣可增大。临床感染是指临床上肉眼不能辨认的病变，但用3%-5%醋酸液局部外涂或湿敷5-10分钟可在HPV感染区域发白，即所谓“醋酸白现象”。
1、典型皮损为生殖器或肛周等潮湿部位出现丘疹，乳头状、菜花状或鸡冠状肉质赘生物，表面粗糙角化。
2、醋酸白试验阳性，活体检测可见类似糜烂图样，中间鲜红至褐色，四周色泽逐渐减淡。
3、核酸杂交可检出HPV-DNA相关序列，PCR检测可见特异性HPV-DNA扩增区带。
4、患者多有不洁性生活史或配偶感染史，少数尖锐湿疣通过接触污染的用具感染。潜伏期1~8个月不等，平均为3个月。
5、尖锐湿疣HPV病毒不溶于血液，但可以通过检测血液中血清抗体，来得到感染病毒的信息。通过病毒检测系统，能迅速化验血清，检测三项，即“病毒抗体、病毒类型、病毒数量”。
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